Θέμα 9: Μοριακή Ανίχνευση Παθογόνων και Ζωονόσων σε Περιβαλλοντικά Δείγματα

Επιβλέπων: Γκολφινόπουλος Σπυρίδων

Συνοπτική Περιγραφή Έρευνας και Απαιτήσεων: Το συγκεκριμένο ερευνητικό μεταπτυχιακό αντικείμενο του προγράμματος ΜΕΔΜΟΔΕ του ΤΜΟΔ εστιάζει στην ανίχνευση παθογόνων, συμπεριλαμβανομένων και των ζωονόσων, σε ύδατα, λύματα και άλλες περιβαλλοντικές μήτρες. Για την επίτευξη αυτού του στόχου, θα χρησιμοποιηθούν προηγμένες μοριακές μέθοδοι, όπως η αλληλούχιση νέας γενιάς (Next-Generation Sequencing, NGS) και η ψηφιακή PCR (digital PCR). Στόχος της έρευνας είναι η ποσοτική και ποιοτική ανάλυση των παθογόνων, προκειμένου να συμβάλει στην αποτροπή ή τον περιορισμό της μετάδοσης ασθενειών στην κοινότητα. Η μεθοδολογία αυτή παρέχει πολύτιμες πληροφορίες για την ποιότητα του νερού, την παρουσία παθογόνων και τη γενικότερη προστασία της ανθρώπινης υγείας και του περιβάλλοντος. Παράλληλα, θα διερευνηθούν οι οικονομικές επιπτώσεις που συνδέονται με την παρουσία αυτών των παθογόνων. Εξετάζονται παράγοντες όπως τα άμεσα κόστη υγειονομικής φροντίδας, οι απώλειες ζωικού κεφαλαίου, η μείωση της αγροτικής παραγωγής, οι επιπτώσεις σε αλιεία, υδατοκαλλιέργειες και το θαλάσσιο οικοσύστημα, καθώς και οι κοινωνικές επιπτώσεις σε τοπικές κοινωνίες (π.χ. αυξημένο κόστος διαβίωσης λόγω χρήσης εμφιαλωμένου νερού). Η οικονομική αποτίμηση θα πραγματοποιηθεί μέσω συνδυασμένης προσέγγισης που περιλαμβάνει οικονομετρικά μοντέλα, εκτιμήσεις υγειονομικών παραμέτρων και αναλύσεις οικολογικών επιπτώσεων. Τα αποτελέσματα της έρευνας αναμένεται να προσφέρουν χρήσιμες πληροφορίες για τη χάραξη στρατηγικών πρόληψης, τη βέλτιστη κατανομή πόρων και την αξιολόγηση πολιτικών για τη δημόσια υγεία και την περιβαλλοντική προστασία.

Στο πλαίσιο της έρευνά, στο πρώτο δίμηνο, η φοιτήτρια/ο φοιτητής θα οριοθετήσει και θα αναπτύξει το θεωρητικό υπόβαθρο της έρευνας και ως το τέλος του 1ου εξαμήνου το θέμα θα έχει αναπτυχθεί σε ικανοποιητικό βαθμό, ώστε να ακολουθήσει η πρώτη έκθεση/ παρουσίαση προόδου (επί της οποίας θα βαθμολογηθεί). Στη συνέχεια θα δημοσιευτούν τα αποτελέσματα της έρευνας, σε συνεννόηση με τον επιβλέποντα και θα ολοκληρωθούν εντός του 2ου εξαμήνου, σε συνέδρια του χώρου. Στο τέλος του 2ου εξαμήνου θα υπάρχουν τα πρώτα αποτελέσματα (αποφάσεις αποδοχής) και αναμένεται να έχουν ολοκληρωθεί και οι παρουσιάσεις/ δημοσιεύσεις ώστε να γίνει η 2η έκθεση/ παρουσίαση προόδου (η οποία επίσης θα βαθμολογηθεί κατά τα ισχύοντα στο πρόγραμμα). Θα ακολουθήσει η συγγραφή της τελικής μεταπτυχιακής εργασίας και η υποστήριξή της ενώπιον της επιτροπής κατά το 3ο εξάμηνο. Σε περίπτωση καθυστέρησης στην ολοκλήρωση των δημοσιεύσεων στα προτεινόμενα συνέδρια, θα επιδιωχθεί δημοσίευση σε περιοδικό ή κεφάλαιο σε βιβλίο κατά το φθινόπωρο - χειμώνα 2026. Η ποιότητα των δημοσιεύσεων θα συνυπολογίζεται στον τελικό βαθμό επίδοσης του φοιτητή.

Ο/Η φοιτητής/τρια θα πραγματοποιεί την έρευνά του και παράλληλα θα έχει τη δυνατότητα να παρακολουθεί ένα μάθημα ανά εξάμηνο κατόπιν εισήγησης της τριμελούς επιτροπής. Τα προτεινόμενα μαθήματα είναι: